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Biologia Molecolare

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Molecular Biology

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Anno accademico 2021/2022

Codice dell'attività didattica
FAR0026
Docente
Dott. Simonetta Oliaro Bosso (Titolare del corso)
Corso di studi
[f003-c504] laurea magistrale in chimica e tecnologia farmaceutiche - a torino
Anno
3° anno
Periodo didattico
Primo semestre
Tipologia
Caratterizzante
Crediti/Valenza
5
SSD dell'attività didattica
BIO/10 - biochimica
Modalità di erogazione
Doppia
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
In parte obbligatoria
Tipologia d'esame
Orale
Prerequisiti
Nozioni basilari di biochimica generale e biochimica applicata.
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

Fornire conoscenze di ingegneria genetica, necessarie per lo sviluppo e la preparazione di farmaci biotecnologici.

Approfondire le conoscenze relative ai meccanismi molecolari e regolativi dell'espressione genica con particolare attenzione alle implicazioni patologiche ed alle possibili applicazioni terapeutiche e biotecnologiche.

The course is aimed to: 1) provide knowledge of genetic engineering, necessary for the development and preparation of biotechnological drugs. 2) deepen the knowledge on molecular mechanisms of gene expression and regulation, giving particular attention to pathological aspects and therapeutic and biotechnological applications.

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Risultati dell'apprendimento attesi

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE Acquisizione di conoscenze relative alla biologia molecolare, in particolare riguardanti la tecnologia del DNA ricombinante, i meccanismi di regolazione genica, le mutazioni del DNA e i meccanismi cellulari di riparazione dei danni al DNA.
CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE Acquisizione della capacità di applicare le conoscenze relative alla biologia molecolare per comprendere e interpretare in modo logico le tecniche di laboratorio e bioinformatiche necessarie per lo studio di queste problematiche.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO Acquisizione di consapevole autonomia di giudizio con riferimento a
valutazione e interpretazione di dati sperimentali per scelte strategiche in situazioni nuove.
ABILITÀ COMUNICATIVE Acquisizione di competenze e strumenti per la comunicazione nella forma scritta e orale, in lingua italiana, unitamente all'utilizzo di linguaggi grafici e formali.
CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO Acquisizione di capacità autonome di apprendimento e di
autovalutazione della propria preparazione, atte ad intraprendere gli studi successivi con un alto grado di autonomia.

KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING Acquisition of the skills concerning molecular biology principles with a focus on recombinant DNA technology, gene regulation mechanisms, DNA mutations and cellular DNA damage repair mechanisms.

APPLYING KNOWLEDGE AND UNDERSTANDING Acquisition of the ability to apply the knowledge of the molecolar biology to understand and interpret in a logical way the laboratory and bioinformatics techniques necessary for the study of these issues.

MAKING JUDGEMENTS Acquisition of aware judgment autonomy concerning evaluation and
interpretation of experimental data in order to achieve strategic choices in unkonw situations.
COMMUNICATION SKILLS Acquisition of oral and written communication skills and expertise, in italian, as well as the ability to use graphical and formal languages.
LEARNING SKILLS. Acquisition of autonomous learning capacity and self-assessment of its
preparation, in order to undertake subsequent studies with a high degree of autonomy.

 

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Modalità di insegnamento

L’insegnamento si articola in 32 ore di didattica frontale, erogata in modalità doppia (in presenza e diretta streaming) e in 16 ore di laboratorio. La frequenza alle lezioni frontali non è obbligatoria, mentre è obbligatoria la frequenza al laboratorio.

Il materiale presentato a lezione (slides) è pubblicato sulla piattaforma Moodle, alla pagina dell'insegnamento.

Sono previsti momenti di interazione con gli studenti/studentesse (collegiali, a piccoli gruppi o

individuali) in presenza, o, qualora non fosse possibile, in remoto.

The teaching is divided into 32 hours of frontal teaching, delivered in dual mode (in presence  and live streaming) and 16 hours of laboratory. The attendance to lectures is optional, while laboratory attendance is mandatory. The didactic material (slides) is published on the Moodle platform.  At the students' request of students, there are opportunities for discussion in small groups or individuals, in presence or, if this is not possible, remotely via Webex.

 

 

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Modalità di verifica dell'apprendimento

La prova d'esame è orale e prevede: 1) la consegna di una relazione scritta relativa all'esperienza svolta in laboratorio. Si dovranno giustificare i risultati ottenuti, i calcoli svolti e saper spiegare le operazioni svolte (valutazione 0-3 punti) - 2) 2/3 domande sugli argomenti in programma. 

L'esame può essere svolto in remoto (attraverso riunioni Webex) solo per esigenze certificate. Gli esami in remoto verranno svolti allo stesso modo.

For certified needs only, the exam can be carried out remotely (through Webex meetings). The exam includes 1) a written report on the experience carried out in the laboratory. The students will have to justify the results obtained, the experimenthal methods and the calculations carried out (0-3 points). 2) 2/3 questions on the topics in the program.

 

Remote exams will be conducted in the same way.

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Programma

- Metodiche (alcune propedeutiche al laboratorio)

Elettroforesi di acidi nucleici. Enzimi di restrizione e mappe di restrizione. Isolamento, purificazione ed analisi del DNA. Il clonaggio del DNA (DNA e proteine ricombinanti ).  PCR e RT- PCR quantitativa. Mutagenesi sito-specifica.  Sequenziamento DNA (Sanger). Tecniche di trasferimento di acidi nucleici dai geli (Southern Blot, Northern Blot). Analisi di polimorfismi della lunghezza dei frammenti di restrizione, sonde molecolari e diagnostica molecolare.

- Proprietà chimico-fisiche del DNA

 Stabilità del DNA, mutazioni e meccanismi di riparazione. Ricombinazione e trasposizione.

Sequenziamento di genomi interi e metodi di sequenziamento di ultima generazione basati sulla sintesi o sulla ligazione.

Banche dati, ricerca , allineamento, confronto di sequenze con BLAST. Banche dati per analisi e confronto di genomi: STS, EST, SNP, annotazione. Trascrittoma e proteoma. PCR e programmi per la progettazione di primers. Programmi per lo studio di di proteine. Analisi  comparativa di sequenze proteiche per individuare aminoacidi con funzioni essenziali

- Tecniche di studio e di soppressione dell’espressione genica

Microarray di DNA  e proteine. Metodo SAGE. CRISP.

- Esercitazioni pratiche in laboratorio

Estrazione e purificazione di DNA plasmidico; digestione di DNA plasmidico con enzimi di restrizione; analisi elettroforetica del DNA; amplificazione di DNA, mediante PCR, da DNA plasmidico

 -Chemical-physical properties, purification and analysis of DNA. Genome sequencing (ligation-based methods). Electrophoresis DNA. Recombinant DNA and recombinant protein.  PCR e RT- PCR. Site-directed mutagenesis.  DNA sequencing (Sanger). Southern Blot and Northern Blot. DNA polymerases. DNA stability, mutations and repair mechanisms. Recombination, transposition.

- Genome analysis and comparison. Nucleic acid and protein data banks, sequences aligments with BLAST. PCR and primers design programs.

-  DNA microarray, proteins and antibodies arrays. SAGE- CRISP.

- Laboratory Practical exercitations.

Some practical exercitation choosing among : plasmide or genomic  DNA purification ; digestion with restriction enzymes; DNA electrophoresis; PCR.

 

 

 

Testi consigliati e bibliografia



Oggetto:
Libro
Titolo:  
Fondamenti di Biologia Molecolare
Anno pubblicazione:  
2008
Editore:  
Zanichelli
Autore:  
Lizabeth A. Allison
Obbligatorio:  
No
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Viene fornito il materiale utilizzato per le lezioni (slides) prima delle stesse. Tale materiale
funge da supporto e guida allo studio e alla preparazione all'esame.

Altri testi consigliati:

F. Amaldi, P. Benedetti, G. Pesole, P. Plevani : "Biologia molecolare" CEA 2014, Zanichelli

M. Cox, J.A. Doudna, M. O'Donnel:  "Biologia molecolare", Zanichelli

M. Maccarone: ″Metodologie biochimiche e biomolecolari″. Zanichelli


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Note

Le modalità di svolgimento dell'attività didattica potranno subire variazioni in base alle limitazioni imposte dalla crisi sanitaria in corso. In ogni caso è assicurata la modalità a distanza per tutto l'anno accademico.

The methods of the teaching activity may undergo variations based on the resctrictions from the current health crisis. In any case, the lessons can be followed in live streaming for the whole academic year.

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Ultimo aggiornamento: 07/11/2021 23:53

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