- Oggetto:
- Oggetto:
Biologia Molecolare
- Oggetto:
Molecular Biology
- Oggetto:
Anno accademico 2020/2021
- Codice dell'attività didattica
- FAR0026
- Docente
- Dott. Simonetta Oliaro Bosso (Titolare del corso)
- Corso di studi
- [f003-c504] laurea magistrale in chimica e tecnologia farmaceutiche - a torino
- Anno
- 3° anno
- Periodo didattico
- Primo semestre
- Tipologia
- Caratterizzante
- Crediti/Valenza
- 5
- SSD dell'attività didattica
- BIO/10 - biochimica
- Modalità di erogazione
- A distanza
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- In parte obbligatoria
- Tipologia d'esame
- Orale
- Prerequisiti
- Nozioni basilari di biochimica generale e biochimica applicata.
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Fornire un approfondimento delle conoscenze relative ai meccanismi molecolari informazionali e regolativi dell'espressione genica con particolare attenzione alle implicazioni patologiche ed alle possibili applicazioni terapeutiche e biotecnologiche. Introdurre ai concetti e alle applicazioni delle tecnologie dedicate all'analisi estesa del genoma, inclusi l'utilizzo di banche dati e l'analisi computerizzata dei dati generati da questi studi.
The course is aimed to: i) deepen the knowledge on molecular mechanism of gene expression and regulation, giving particular attention to pathological aspects and therapeutic and biotechnological applications; ii) give an introduction to theory and technologies of genomics, including the use of databases and computer analysis of molecular data.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Acquisizione di conoscenze approfondite dei meccanismi di espressione e regolazione genica, negli aspetti fisiologici e patologici, e di tecniche di laboratorio e bioinformatiche necessarie per lo studio di queste problematiche.
Students are expected to increase their knowledge on the mechanism of gene expression and regulation, both physiological and pathological, and to learn laboratory and informatic techniques for this type of studies.
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
L’insegnamento si articola in 32 ore di didattica a distanza, erogate in diretta streaming, e in 16 ore di laboratorio. Le lezioni vengono registrate e pubblicate, insieme al materiale presentato a lezione, sulla piattaforma Moodle.
Sono previsti momenti di interazione con gli studenti (collegiali, a piccoli gruppi o
individuali) online o, dove possibile, in presenza con chi può e online con chi segue la
didattica a distanza.
- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
L'esame si svolge in modalità telematica attraverso una o più riunioni Webex, a seconda del numero di iscritti all’esame stesso. L’eventuale suddivisione viene comunicata dopo la chiusura delle iscrizioni.
I candidati devono disporre di una telecamera, di un microfono, di uno foglio bianco e di un pennarello nero. Ad ogni candidato viene chiesto di mostrare un documento di identità. La telecamera deve essere tenuta accesa durante tutta la durate dell’esame, ed essere posizionata in modo da inquadrare lo studente, lo spazio circostante e le proprie mani quando sta svolgendo un esercizio.
Durante l’esame i candidati non possono utilizzare materiale didattico in forma cartacea od elettronica, pena l’immediata interruzione della prova con esito insufficiente.
Si ricorda che non sono consentite registrazioni audio e/o video della prova di esame. Qualora si venisse a conoscenza di eventuali registrazioni e loro divulgazioni si procederà a norma di legge.
La prova d'esame è orale e prevede: - la consegna di una relazione scritta relativa all'esperienza svolta in laboratorio. Lo studente dovrà giustificare i risultati ottenuti, i calcoli svolti e saper spiegare le operazioni svolte (valutazione 0-3 punti) - la consegna di una relazione scritta relativa all'esercitazione sull'utilizzo di banche dati biologiche e di programmi bioinformatici (valutazione 0-3 punti) - 2/3 domande sugli argomenti in programma (valutazione 0-12 punti). Il raggiungimento del massimo punteggio in tutte le sezioni di esame comporterà l'attribuzione della lode.
- Oggetto:
Programma
- Metodiche (alcune propedeutiche al laboratorio)
Elettroforesi di acidi nucleici. Enzimi di restrizione e mappe di restrizione. Isolamento, purificazione ed analisi del DNA. Il clonaggio del DNA (DNA e proteine ricombinanti ). PCR e RT- PCR quantitativa. Mutagenesi sito-specifica. Sequenziamento DNA (Sanger). Tecniche di trasferimento di acidi nucleici dai geli (Southern Blot, Northern Blot). Analisi di polimorfismi della lunghezza dei frammenti di restrizione, sonde molecolari e diagnostica molecolare.
- Proprietà chimico-fisiche del DNA
Stabilità del DNA, mutazioni e meccanismi di riparazione. Ricombinazione e trasposizione.
- Confronto ed analisi di sequenze geniche e genomi (in parte svolto presso l’aula informatica di TOExpo, alcuni programmi verranno utilizzati in laboratorio)
Sequenziamento di genomi interi e metodi di sequenziamento di ultima generazione basati sulla sintesi o sulla ligazione.
Banche dati, ricerca , allineamento, confronto di sequenze con BLAST. Banche dati per analisi e confronto di genomi: STS, EST, SNP, annotazione. Trascrittoma e proteoma. PCR e programmi per la progettazione di primers. Programmi per lo studio di di proteine. Analisi comparativa di sequenze proteiche per individuare aminoacidi con funzioni essenziali
- Tecniche di studio e di soppressione dell’espressione genica
Microarray di DNA e proteine. Metodo SAGE. CRISP.
- Esercitazioni pratiche in laboratorio
Estrazione e purificazione di DNA plasmidico; digestione di DNA plasmidico con enzimi di restrizione; analisi elettroforetica del DNA; amplificazione di DNA, mediante PCR, da DNA plasmidico
-Chemical-physical properties, purification and analysis of DNA. Genome sequencing (ligation-based methods). Electrophoresis DNA. Recombinant DNA and recombinant protein. PCR e RT- PCR. Site-directed mutagenesis. DNA sequencing (Sanger). Southern Blot and Northern Blot. DNA polymerases. DNA stability, mutations and repair mechanisms. Recombination, transposition.
- Genome analysis and comparison. Nucleic acid and protein data banks, sequences aligments with BLAST. PCR and primers design programs.
- DNA microarray, proteins and antibodies arrays. SAGE- CRISP.
- Laboratory Practical exercitations.
Some practical exercitation choosing among : plasmide or genomic DNA purification ; digestion with restriction enzymes; DNA electrophoresis; PCR.
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Agli studenti viene fornito il materiale utilizzato per le lezioni (slides) prima delle stesse. Tale materiale
funge da supporto e guida allo studio e alla preparazione all'esame.L.A. Allison: "Fondamenti di Biologia molecolare ", Zanichelli
F. Amaldi, P. Benedetti, G. Pesole, P. Plevani : "Biologia molecolare" CEA 2014, Zanichelli
M. Cox, J.A. Doudna, M. O'Donnel: "Biologia molecolare", Zanichelli
M. Maccarone: ″Metodologie biochimiche e biomolecolari″. Zanichelli
- Oggetto:
Note
http://www.farmacia-dstf.unito.it/do/corsi.pl/Edit?_id=13a4
- Oggetto:
